Las ONG y la OIM cooperan en la concienciación de migrantes potenciales y en el fortalecimiento institucional gubernamental en materia de lucha contra la trata de personas. Las ONG también desempeñan un papel preponderante en los programas de la OIM que prestan asistencia a las víctimas de la trata al ofrecer albergue y servicios de protección, asesoramiento y apoyo médico, así como asistencia para el retorno y la reintegración.

Las ONG y la OIM trabajan conjuntamente a fin de organizar o llevar a cabo talleres, seminarios y campañas de difusión de información encaminadas directamente a la concienciación en materia de derechos humanos de los migrantes. La OIM y las ONG también realizan estudios y acopian información a fin de identificar y encarar cualquier tipo de abuso.

En situaciones de emergencia y posconflicto, la OIM trabaja con las ONG en diversas actividades, por ejemplo: organizando evacuaciones y retornos seguros y ordenados de poblaciones desplazadas; proporcionando albergue y asistencia humanitaria en situaciones de emergencia; velando por que se identifiquen y encaren las preocupaciones en materia de protección; llevando a cabo censos y encuestas; y organizando el retorno y reintegración de desplazados internos, así como de excombatientes y personas a su cargo.

Las ONG son asociados importantes para promover la migración laboral regular en el marco de la lucha contra la migración irregular; fomentar el desarrollo socioeconómico de los países de origen, tránsito y destino; y velar por el respeto de los derechos e integridad de los trabajadores migrante

El equipo médico de salud de la OIM trabaja en estrecha colaboración con las ONG para encauzar las evaluaciones de salud de posibles migrantes y refugiados con miras a su reasentamiento y retorno, y para encarar toda una gama de cuestiones de salud.